若患者由于肠胃炎而出现腹部绞痛时，可使用解痉挛药物，如阿托品、654-2类药物，对肠胃炎腹部绞痛有帮助。但肠胃炎治疗非单一治疗而为综合性治疗，如果仅用解痉药解决腹痛，但肠胃炎本身未经过认真治疗，腹部绞痛还可以继续发生，因此需针对病因进行治疗。

如果肠胃炎因细菌感染引起，需使用抗生素进行治疗，主要根据病情的严重程度由医生决定所采取治疗方案。若轻症可口服喹诺酮类的抗生素，如左氧氟沙星、黄连素等。若症状比较重，比如体温达38-39℃时，此时需静脉用药，如头孢类抗生素等。