先天性心脏病引起缺氧常见原因如下：

1、部分静脉血没有经过肺循环氧合的过程，直接通过先天性心脏病的异常通道，从右侧心脏直接进入左侧心脏，即静脉血没有在肺中得到充分的氧合便进入动脉，在给心、脑、肾、肌肉、胃肠区供血时，血中的含氧量较低而引起缺氧；

2、如肺动脉瓣狭窄、肺动脉梗阻的病人，血液难以从右心进入到肺循环中，阻力相对较高，使静脉血难以得到快速、充分地氧合，导致比较明显的心力衰竭。还有部分先天性心脏病可能是发生在左侧心脏，比如主动脉瓣异常、二尖瓣异常，瓣膜长期的改变导致左心衰竭，导致肺中淤血，也会引起缺血、缺氧。