碱性磷酸酶是肝功能中的检测指标，因此碱性磷酸酶的升高并不是升高存在什么危害，而是碱性磷酸酶升高的病因有可能会造成相应的危害，因为碱性磷酸酶升高的原因包括生理性以及病理性，生理性原因包括部分儿童的发育期、妊娠、青春期、骨骼发育等，都会导致碱性磷酸酶轻度偏高，这种情况下并不存在相应的危害。如果是病理性原因，包括由肝胆疾病而造成，如肝癌、肝外胆道梗阻、胆道感染、肝内胆汁淤积、肝硬化等因素，导致碱性磷酸酶偏高，它具体的危害就取决于原发肝胆疾病的危害性、严重性。
良性疾病与恶性疾病危害程度又有明显的差异，包括骨骼疾病，比如佝偻病、软骨病、骨恶性肿瘤、恶性肿瘤骨转移，也有可能会引起碱性磷酸酶偏高。因此它也存在着良性疾病与恶性疾病的危害差别，甲状旁腺功能亢进也会引起碱性磷酸酶的偏高，患者要查明病因才能明确病因的危害程度、危害性。
