脑脓肿手术的后遗症可能并不是由于手术导致，根据患者脑脓肿大小和发生部位不同，患者手术后通常会出现头疼和头晕等症状。对于功能区的脑脓肿，通过手术等治疗后，虽然囊肿痊愈，但是局部瘢痕可能会造成患者出现神经功能减退，根据部位，症状主要包括以下几种：

1、语言功能区域：可能会导致患者语言功能下降，如失语和部分失语等；

2、运动区域：有可能造成患者肢体功能和运动功能下降；

3、其他部位：可能造成患者脑功能下降，包括记忆力、思维能力下降等。