一般牙齿咬合不齐危害会比较大，有80%的人可能会出现不同程度的牙龈炎、牙龈出血以及牙结石，严重的时候还会出现牙面的色素沉着、口臭或者龋齿等现象。这主要是因为牙齿咬合不齐的情况下，牙面有凹凸不齐，牙与牙之间的不良接触关系，形成不易清洁的区域，这些区域容易停留牙菌斑或者食物残渣，不利于清洁。

咬合不齐还会导致咀嚼时个别牙齿承受的咬合力量过大，引起牙周负担的增重，严重时可能会导致牙齿折断、牙根外漏等情况。另外，还会导致颞下颌关节紊乱，引起关节区的疼痛、弹响。