如果怀疑颅内感染，首选无创性头颅CT或者核磁检查。如果仅表现在脑膜， CT、核磁检查可能没有发现明显异常。如果不仅在脑膜，还局限在脑部，CT和核磁可以发现异常，但影像学表现异常对治疗没有帮助，只是明确诊断。还要做脑脊液检查，了解颅内压力高低，了解细胞分类情况，根据分类确定病人是病毒感染还是细菌感染，以及用抗病毒治疗还是抗细菌治疗。
针对不同细菌感染可选取不同治疗方法，通过脑脊液生化，比如糖和氯化物情况确定哪一类细菌，比如隐球菌、结核菌、脑膜炎球菌，病人糖和氯化物降低，尤其结核菌，氯化物更低。化脓性脑膜炎球菌引起的感染，糖降低更明显，间接通过生化指标确定是哪一类细菌。还可以做细菌培养和药敏检查，根据药敏检查选取敏感抗生素，做到针对性治疗，可以彻底治愈颅内感染，所以要及早就医，尽快诊断、治疗。
