慢性肾小球肾炎的预后，与发现慢性肾小球肾炎时的蛋白尿水平、血压水平、肾功能状态以及肾脏病理密切相关。如果慢性肾小球肾炎发现比较早，仅表现为血尿、少量蛋白尿，没有肾性高血压，血肌酐正常，经过积极治疗一般预后较好。

慢性肾小球肾炎出现大量蛋白尿，或者伴有肾性高血压、肾功能损害比较轻时，肾脏病理表现为局灶增生肾小球硬化时，经过积极控制血压、减少蛋白尿，可以延缓血肌酐进展。当慢性肾小球肾炎患者出现大量蛋白尿，或者血尿比较突出，甚至反复出现肉眼血尿、不易控制的高血压或者出现肾功能中度损害时，肾脏病理除肾小球系膜细胞、系膜基质的增生外，有比较多的节段硬化或者球形硬化、缺血性硬化时，常提示向肾衰竭、尿毒症的方向发展。