原发性三叉神经痛的病因为血管压迫神经，因此血管减压手术为目前主要且为首选的治疗方法，手术微创，恢复较快，效果也较好，比较适合年轻人、药物治疗不佳的患者，对于老年患者一般75岁以上会使手术风险增加，尤其是患者有心血管方面的基础疾病，可能不太适合全麻手术，可以采取其它方法，如三叉神经半月节毁损术或酒精、甘油注射毁损，还有放射外科γ刀、射波刀毁损三叉神经根部，均可治疗三叉神经痛。因为是破坏性手术，手术后立竿见影，但一般都有面部麻木或后遗症，当神经逐渐恢复时，可能疼痛又发作，所以一年以内很容易复发。

其它的方式还有球囊压迫、封闭治疗、感觉根切断等。早期手术效果较好，但复发率逐年增加，老年患者不能耐受全麻减压手术时或减压手术术后又复发，可以采取毁损手术。因为是毁损，主要并发症是面部感觉丧失或有些麻木，也有些患者可能出现角膜干涩或角膜溃疡。因此最终的手术方法要根据患者年龄、病情、患者对手术效果的要求来综合考虑，不能千篇一律都采取一种手术方法。