新生儿脑积水从治疗角度而言有治愈可能性，对于严重脑积水已造成脑脊液循环通路梗阻时，则需区别对待，包括吸收性脑积水、脑炎后期的整个蛛网膜下腔。蛛网膜颗粒吸收严重受阻，脑室进行性增加，脑室周围水肿戴帽征较为明显，且落日征严重患者，临床可判断出脑脊液循环吸收无法达到自我平衡，此时需积极外科干预。

轻度脑积水仅表现为颅压轻度增高，脑室有轻度戴帽状表现，早期可采用相对温和内科保守治疗包括脱水、营养神经，从而改善颅内压促进脑发育，为脑脊液吸收循环创造条件。疾病发展后期，需对患者脑积水吸收循环平衡能力进行客观分析。

对于梗阻性脑积水，如果早期已发现脑脊液循环通路由于肿瘤、先天畸形、粘连等造成阻塞，此时脑脊液循环吸收功能较难达到自我平衡，必要时可通过三脑室体造瘘等微创手术促进脑发育，进一步改善脑功能。