确定危险度或者良恶性一般是根据肿瘤大小、核分裂象、生长部位、肿瘤有无破裂或穿孔等。一般肿瘤直径＜2cm，核分裂象＜5个，即可确定为极低危险度的胃肠间质瘤。极低危险度的间质瘤手术以后一般不需要再辅助药物治疗，对中高危以上的胃肠间质瘤，手术以后则要用靶向药物来继续辅助治疗。

胃肠间质瘤是一种比较少见的胃肠道肿瘤，胃肠道肿瘤最常见的是胃癌或者肠癌，胃肠间质瘤比较少见。它是一组的疾病，有偏良性、偏恶性情况，还有在良恶性之间的肿瘤，所以治疗要分层进行。