超声检查主要应用超声波进行成像，而并无电离辐射，相对而言更加安全、价格更加便宜，临床应用较简便，可提供较多脏器诊断信息。CT主要应用放射线进行成像，有一定放射性，而进行CT检查时会对人群有所选择，如孕妇更倾向于选择超声等。

CT检查优点为可进行更大范围成像，同时由于CT为断层成像，检查图像较为规范。因此CT图像在不同医疗机构间有更好互通性，而超声成像由于检查医生操作差异性较大，超声图像互认性较CT弱。