酒精喷在阴茎上有危害，会造成患者疼痛难忍。在临床上如果需要进行阴茎、阴囊的消毒，不建议选用酒精，通常会选用相对温和的碘伏，进行消毒。例如导尿的操作，常用导尿包中的碘伏棉球进行消毒，如果使用酒精，会造成患者的剧烈疼痛。

部分患者认为射精时间短，龟头敏感度高，使用酒精可以提高龟头耐受力，为错误错误，将酒精喷在阴茎上不能起到延时作用。如果进行此类操作，会因为酒精刺激，造成化学性的包皮龟头炎，既无法解决男科问题，又增加包皮的瘙痒、疼痛。