单心室患者应在早期发现后尽早治疗，以减轻痛苦，尤其是儿童将长期影响发育，症状严重者可缩短寿命。如果不进行手术干预，患者即便轻微活动，也可导致呼吸困难，严重影响生活质量。对于成年女性，单心室无论是否已接受手术治疗，均不建议怀孕。

单心室属于较罕见先天性心脏，对患者影响较大，多数患者早期有明显复杂先天性心脏病表现，如发绀、心动过速、体重缓慢增加与消瘦。长期发展可明显发绀，出现心肌损伤，甚至导致充血性心力衰竭。对肺血增加患者，如果早期未发现则寿命较短，主要是由于充血性心衰、心律失常或猝死所致。