上消化出血病因诊断的最佳检查方法，首选急诊内镜即急诊胃镜。可以迅速帮助明确消化道出血的病因，如可以观察是否有溃疡、胃黏膜糜烂、出血、肿瘤、食管-胃底静脉曲张破裂出血等情况。同时是非常好的治疗手段，通过在内镜下喷洒药物或使用钛夹，有助于控制上消化道出血。
急诊胃镜是有创检查方法，也称为侵入性检查方法。大部分基层医院未开展此项目，部分老年患者或高危患者检查风险较大时，可以选择腹部CT、超声、核磁等无创影像学检查，可提供上消化道出血的病因、诊断信息。通过此类影像学检查，可明确患者是否有肝病、肝硬化、食管-胃底静脉曲张、胃部十二指肠或其他部位肿瘤等疾病，也可以初步提示出血的病因。因此要根据患者的临床情况，评估消化道内镜检查的风险和获益，选择最适合病人的检查方法进行病因诊断。
