胆囊切除手术若采取正规操作，则不会遗留后遗症。但是在胆囊切除之前，如果胆囊功能还比较好，可能具有一定的消化功能。所以切除了之后，消化脂肪能力会差一点。手术后前几个月如果吃油腻食物，因为消化不彻底，可能会导致腹泻。这种腹泻的情况实际上经过人体代偿以后也会得到改善，因为胆囊切除以后胆总管会轻度扩张，代替原来部分胆囊的功能，浓缩和储存胆汁。
如果胆囊切除以后，胆囊管留得过长，如果胆囊管里面还残余小结石，医学上叫胆囊术后胆囊管综合征，或术后小胆囊综合征，是因为当时手术没有做到彻底，可能需要二次手术，把残余胆囊管完整切除、连根拔除才可以消除。
