胚胎移植不着床，即移植之后妊娠失败，最主要的原因是胚胎问题。做一代和二代试管时进行胚胎筛选，均是形态学筛选，如细胞分裂数、碎片率、细胞形态是否差异性太大，进行胚胎评估，达到标准再进行移植。但可能存在胚胎形态很好，而染色体异常，或基因有特殊状况。

但在做一代和二代试管婴儿时，并没有进行此方面检测，所以有可能胚胎形态好，但染色体有异常，导致胚胎着床失败。

此外，还有一些其它原因，如宫腔病变，或免疫性问题，甚至不明的原因均会导致胚胎着床失败。