硫酸异帕米星主要具有抗菌作用，是氨基糖苷类的抗菌药物，这类药品主要通过抑制病原菌蛋白质的合成，起到抗菌作用。硫酸异帕米星主要对革兰氏阴性菌具有比较好的作用，比如大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、产气肠杆菌、铜绿假单胞菌等。

临床上硫酸异帕米星主要可以用于支气管炎、肺炎、支气管扩张合并感染的治疗。另外，还可以用于泌尿系统感染，包括膀胱炎、肾盂肾炎、尿道炎等，此外还可以用于敏感菌所导致的败血症，另外还能用于手术的抗感染治疗。