卵巢囊肿多数情况不是不来月经的原因，而是不来月经的结果，囊肿可以通过人为的方法来1次月经，再决定是否为病理性囊肿，如果囊肿消失，通常无需处理，如果不消失且直径>5公分，可能需要做手术。由于不来月经，所以卵巢的囊肿可能一直未消失或者减小，应考虑不来月经的原因，具体原因如下：
1、怀孕：怀孕可以导致不来月经，同时也容易产生生理性的卵巢囊肿，应做相应检测；
2、内分泌问题：可能性较多，如下丘脑受到影响，减肥、紧张、劳累、环境改变均可对下丘脑的指令产生影响；
3、卵巢本身问题：卵巢功能较差等；
4、子宫内膜：可能对卵巢发放的使命不敏感，可能存在损伤，所以不能随着激素波动而改变。
