甲状舌管囊肿好发的部位是颈前部正中，从舌盲孔到胸骨切迹之间的任何部位。通常以舌骨体上下方最为常见，有时可以偏向一侧，更多的是于颈部正中线的位置上。

甲状舌管囊肿是胚胎早期甲状腺的发育过程中，甲状舌管退化不全、不消失而在颈部遗留，所形成的一种先天性囊肿。甲状舌管囊肿的发生，没有明显的性别差异，男女都可以发生，任何年龄都可以发生，通常在30岁上下的青少年最为多见。

临床上见到的甲状舌管囊肿，通常质地较软、边界清楚，与表面的皮肤和周围组织没有明显粘连。因为位于舌骨上下方，囊肿和舌骨体之间会有一个坚韧的条索状物质相连接。随着吞咽、伸舌等动作，囊肿会上下移动，这也是甲状舌管囊肿的一个典型表现。

因为甲状舌管囊肿通常跟舌盲孔、口腔相通，容易发生感染。感染发生的时候，会出现明显疼痛，吞咽时疼痛加重，颈部可以看到囊肿表面皮肤发红，界限不清楚。

如果囊肿自行破溃而出现了流脓，或者切开引流以后，就形成甲状舌管瘘。从这一方面可以看到甲状舌管囊肿组织发生的原因，所以甲状舌管囊肿最好发的部位一定是颈前部正中，沿着中线的地方，从舌盲孔一直到胸骨切迹，当然最常发生的还是舌骨上下部位。