脊索瘤是一种低度恶性肿瘤，突出的特点为肿瘤呈侵袭性生长，常常累及周围的重要结构。对于脊索瘤的治疗方法还是以根治性手术切除为主，尽可能通过手术进行肿瘤全切，甚至有时需要适当扩大肿瘤切除的周原，尽可能将肿瘤做到全切除。如果脊索瘤累及到重要的血管、神经等结构，不能实现全切时，则需要考虑对周围的病变在手术切除之后进行放疗，延缓肿瘤复发。

在临床上对于复发的脊索瘤，有时还是需要进行再次手术，或者进行局部的立体定向放射外科的治疗方法。因为组织局部接受种生的剂量有限，尤其涉及到头部发生病变时，病变部位接受放疗剂量有限，所以需要采取立体定向放射外科治疗的方法，针对肿瘤的很小的范围进行照射。