男童尿路感染通常与包皮炎、包茎有关，所以男童在确诊、怀疑尿路感染时，要先查看包皮有没有红肿、包茎的存在。可以先应用外用药，比如红霉素软膏，或者百多邦(莫匹罗星软膏)，涂抹在包皮处，由此造成一些尿频、尿急症状，会相应缓解、减轻。
在后期可以用气囊扩张的方法，来扩大包皮口，避免类似感染继续发生。
当查尿时发现尿液中有大量的白细胞，这时可能细菌已经从尿道外口进入到尿道、到了膀胱，在这些尿路黏膜的表面定殖，造成尿路黏膜充血、水肿，会带来尿频、尿急、尿痛，甚至有时出现血尿的状况。
这时要选择合理的抗生素，对于男童而言一般不推荐喹诺酮类，因为会影响其骨骼发育。如果没有青霉素过敏史，没有头孢类药物的过敏史，这时先选择的是头孢类抗生素，比如希刻劳(头孢克洛缓释片等)。可以按照男童体重，选择较低的剂量来进行治疗，一般疗程也是3-7天。
在治疗1周以后，需要再次复查尿常规，直到尿常规中白细胞转阴，才算治疗终止。
