系统性红斑狼疮为多器官、多系统受累的疾病，所以狼疮肾炎的临床表现较多，可表现为急性肾炎综合征，也会表现为肾病综合征以及活动性血尿、蛋白尿、白细胞尿等。但是有1/4的患者会表现为大量蛋白尿，同时伴有水肿。部分患者会出现不同程度的肾功能异常，如血肌酐、尿素氮升高，狼疮肾炎还会出现明显的远端和近端肾小管异常。
狼疮肾炎的肾外表现也是多样的，会出现皮肤黏膜、关节肌肉、血液系统、中枢神经系统、心血管系统等不同程度受累。若狼疮肾炎患者在血液系统受累，会表现为自身免疫性溶血性贫血、血小板减少、白细胞减少等表现。患者还会出现脱发、蝶形红斑等肾外表现。