小儿脑炎后遗症眼球麻痹主要是脑炎引起支配眼球的运动神经受累，即大脑、脑干、桥脑的侧视中枢受累导致眼球的麻痹。眼球麻痹在临床治疗非常棘手，通过多年治疗经验，其治疗方法如下：
1、综合康复加位点及穴位注射效果较好，采用脑细胞营养剂和脑细胞神经系统修复剂、维生素类药物等，注射在患者头部的不同区域，如支配眼球运动神经的走行，使受累的脑细胞病灶周围加以代偿，进一步改善病灶区的血液循环，促使眼球运动恢复；
2、理疗、电针、经颅磁刺激对眼球运动的恢复有很大帮助；
3、注意避免强光，防止眼部感染，必要时戴眼罩。
