男性和女性的梅毒治疗并没有特殊的区别，使用的药物相同。梅毒治疗首选药物是青霉素，对梅毒整体疗效较好，主要为长效青霉素与水剂青霉素。其中长效青霉素由于使用方便，临床使用较多。如果患者存在神经系统感染，为神经梅毒的情况，可使用水剂青霉素进行治疗。
如果患者对青霉素过敏，既往有严重过敏反应，无法使用青霉素，还可以选择四环素类药物和大环内酯类药物。四环素类药物包括盐酸四环素、米诺环素 、多西环素等，对梅毒整体治疗效果较好。但四环素类药物不能用于孕妇和哺乳期妇女的治疗，孕妇和哺乳期妇女的治疗可以考虑使用红霉素，效果较好。另外对新生儿、儿童的治疗，也可以选择红霉素。阿奇霉素对梅毒的治疗也具有一定疗效，在患者不能使用青霉素或四环素类药物的情况下，还可以考虑使用阿奇霉素进行治疗。
