对舌根囊肿的治疗，需考虑囊肿大小、部位和对功能的影响，具体如下：

1、小囊肿：患者一般没有任何症状，检查时无意间发现局部囊肿存在，且功能没有产生影响，一般采取观察策略，避免局部刺激，减少舌根部炎症反复发生，定期拍片观察囊肿大小的发展和变化。若一直没有症状，囊肿大小不变，可不必过分担心，继续观察；

2、大囊肿：伴有功能影响，可明显影响患者语言和进食功能，如吞咽不适感和异物感、说话有橄榄音。此时需积极手术治疗，通常在全麻下进行，让患者彻底放松，将舌头向前牵引，局部做根治性切除，对伤口做严密缝合。术后要加强口腔卫生，必要时进行抗炎治疗，减轻局部炎症，避免局部出血、肿胀发生。

综上，对舌根囊肿的治疗，需根据囊肿大小、部位以及对功能的影响、发展速度采取相应治疗方式，在合理时间实施。