眼部长扁平疣原因为人乳头瘤病毒传染至眼部，为病毒感染所致。眼部长扁平疣常见处理办法如下：

1、外用药物：可以涂抹干扰素或维A酸软膏，抑制病毒生长、增殖；

2、刮除疣体：局部麻醉后可以将瘤体刮除，但刮的时候要慎重，眼皮比较薄，应避免损伤眼皮；

3、物理治疗：可以应用激光或微波方法对疣体进行烧灼；

4、注射药物：局部注射聚肌胞或干扰素进行治疗。