引起阴茎水肿的原因较多，最常见的是血管性水肿，较多见于小孩或青少年，通常是由于玩弄阴茎或手淫刺激引起。临床表现为突发的包皮水肿，如果包皮的积液量较多常呈透明状，水肿往往集中在阴茎的前1/3，患者可能会有排尿的轻微刺痛感。

血管性水肿通常进行冷敷处理，也可口服抗组胺或糖皮质激素进行治疗，可促进水肿的吸收。如果不进行治疗，数日后也可自行恢复。与之要进行鉴别的水肿类型，包括阴茎的丹毒、刺激性皮炎等。

除此之外，其他系统的疾病也可能导致阴茎水肿的发生，比如内科疾病中由于低蛋白血症或心衰，尤其是右心衰影响到血液回流时会出现阴茎水肿，所以出现阴茎水肿要结合各方面因素进行分析判断。