滴眼药水眼睛疼的原因有很多，正常反应比如滴用方法不正确、含有防腐剂刺激导致，还可能是异常反应，如药物过敏、角膜损伤、眼药水过期等。

一、正常反应

1、滴用方法不正确：正确滴眼药水的方式是一手扒开眼窝，一手挤压眼药水瓶，将药水滴注其中。如果直接将药水滴在眼球上，可能会刺激眼睛，引起疼痛；

2、含有防腐剂：眼药水中含有防腐剂的目的是防止开封后，与空气接触而变质，但部分人眼睛敏感，可能会因刺激而有疼痛感。

二、异常反应

1、药物过敏：患者对眼药水中所含的某种成分过敏，滴用后对眼睛产生刺激，可有疼痛、视物模糊等表现；

2、角膜损伤：频繁揉眼或是划伤等导致眼角膜破损，滴眼药水时会刺激伤口处引发疼痛；

3、眼药水过期：超过眼药水的有限使用期，药水已经发生变质，再使用时会刺激眼睛引起疼痛等不适。

除了上述原因外，还可能是因为结膜炎等疾病因素导致。如果疼痛轻微，且能短时间内自行消失，一般无需紧张。但是如果每次滴用眼药水时均有疼痛现象，应暂停滴用，及时就医查明原因并给予治疗。