怀孕五周肚子疼，可能是病理性因素，如先兆流产、异位妊娠所致，也可能是孕妇在孕早期进行性生活所致。

1、先兆流产：怀孕五周属于孕早期，胎像不稳，很多孕妇会表现为小腹疼痛，或者阴道出血、腰酸。

如果小腹疼痛不剧烈，出血量比较少，可以采取保胎治疗，经过保胎之后症状缓解，可以继续妊娠。如果小腹疼痛越来越严重，阴道出血量增多，这种情况流产不可避免，建议尽早进行药物流产或者清宫手术。

2、异位妊娠：孕妇怀孕以后，要进行妇科彩超和hCG的检查，排除异位妊娠。异位妊娠会伴有小腹的疼痛和阴道不规则流血，一旦确诊，应立即就医进行治疗。

3、性生活：很多孕妇在怀孕的初期仍然有性生活，会引起子宫收缩，从而会导致小腹的疼痛或者阴道的少量出血，在孕早期禁止同房。

在怀孕早期建议要多休息，不要劳累，在饮食上要加强营养，饮食要均衡。