大部分脓肿需要手术治疗，脓肿是常见疾病，常由局部严重感染导致，会出现局部积脓。如果不用手术方式将脓液排出，脓液便只能被身体缓慢吸收。而在这个过程中，细菌可能会广泛扩散，通过血液循环导致脓毒血症、菌血症等问题。
发现脓肿后应尽快去医院相关科室进行手术治疗。若脓肿病情不严重，通常只需在脓肿局部进行麻醉，然后切开排脓，再规律换药即可。若脓肿较严重，则需在连续硬膜外麻醉或全麻下进行彻底清创。
无论是何种类型的脓肿，通常都需要使用抗生素治疗。有时口服抗生素即可，有时则需输液治疗。常用的抗生素包括头孢呋辛、头孢他啶、甲硝唑、奥硝唑等。
不同部位的脓肿需选择不同科室进行手术。如脓肿位于普外科相关部位需去普外科就诊，若位于骨科相关部位则需去骨科就诊。若在夜间或节假日就诊，可能需要去急诊外科。若不确定该去哪个科室，可向医院分诊台进行咨询。
在患有脓肿这种疾病后，应避免饮用含有酒精的饮品，不要吃过于辛辣的食物，以免病情进一步加重。
