心肌炎的诊断主要为临床诊断，确诊需要心内膜心肌活检。
心肌炎是心肌受各种理化因素影响，尤其是病毒感染造成的炎症性疾病；同时心肌炎的临床表现各有不同，因而目前心肌炎的主要诊断根据典型的前驱感染症状，如患者发病前1-3周的发热、疲倦、肌肉酸痛等上呼吸道感染症状或恶心、呕吐、腹泻等消化道症状；同时包括当心肌受累时心悸、胸闷、胸痛等心脏症状及心律失常、心脏杂音、心衰、休克等体征；以及心电图、心肌酶学、超声心动图、心核磁共振等检查。
但如需确诊，需要根据心内膜心肌活检，研究证实，心内膜心肌组织活检不仅具有诊断价值，同时具有预后评估价值。但是由于受现有设备及临床经验影响，心内膜心肌组织活检尚不能在临床上广泛开展。尤其对于轻症患者，一般不常规检查。
心肌炎的诊断主要根据患者的前驱感染史、相应的临床表现、体征及心电图、心肌酶、超声心动等相关检查做出临床诊断；确诊依赖于心肌细胞活检。
