宝宝腹泻需要根据其病因进行治疗，所以药物的选择也需要根据病因进行。如果是由于感染引起的腹泻，建议进行抗细菌、抗病毒治疗，可适当给予抗菌、抗病毒药物。对于非感染性腹泻，可以吃蒙脱石散，有收敛止泻的作用，还可以在医生的指导下适当添加健脾养胃的中成药，有助于腹泻的恢复。
　　另外，还可以试着给宝宝补充益生菌，包括双歧杆菌活菌制剂、乳酸杆菌活菌制剂，如妈咪爱，适用于消化不良、食欲不振、营养不良、肠道菌群紊乱引起的腹泻、便秘、腹胀等病症。如果双歧杆菌作用欠佳，还可以吃四联活菌，能更有效的平衡肠道的微生物环境。
　　除此之外，宝宝腹泻还需要排除是否是乳糖不耐受所致。如果是奶粉喂养的宝宝发生了乳糖不耐受，可以换成无乳糖奶粉。同时注意给孩子补充含盐水分，避免脱水。平时要注意给宝宝吃新鲜的食物，不要吃隔夜的剩饭，不要吃生冷及辛辣刺激性食物，以防出现恶心、呕吐、腹胀、腹泻、腹痛等不适，影响宝宝的正常生长发育。