现在医学对于眼结膜炎的研究来说，发现许多有效的药物，但真正具有跨时代意义的发现，还是明确大部分结膜炎是因为病菌感染导致的，因此抗病菌治疗是治疗结膜炎的首要方法。
由于引起结膜炎的病菌类型各样，并没有哪种药物可以解决所有病菌，所以专家们还是提出根据不同病菌使用不同药物治疗，第一种是抗细菌药物治疗（妥布霉素滴眼液，氧氟沙星滴眼液），第二种就是抗病毒治疗药物（阿昔洛韦滴眼液）。
因为用药受到多种因素的影响，所以需要根据患者具体的不同情况，制定不同的方案，也就需要了解患者的不同情况，比如最近有没有用过药物治疗，具体是用的哪类药物，有没有什么药物过敏，有没有其他基础疾病，有没有其他在用药物，因为部分药物相互之间会有药效影响，同时因为国内抗生素过度应用，导致很大一部分人出现耐药的情况。
综上所述，出现眼结膜炎，一定要尽早去眼科进一步检查，明确诊断后，再在专科医生的指导下，坚持正规用药，这样才可以保证有更好的疗效。
