射精疼痛的原因很多，主要分为器质性，功能性和心理性三种。
射精疼痛的器质性原因主要包括有：精囊炎，前列腺炎，后尿道炎，尿路结石，泌尿系统肿瘤等：最常见的是附睾炎、前列腺炎、精囊炎等。射精时肌肉收缩引起疼痛。其次尿道后结石，尿道狭窄阻塞也可引起疼痛，射精管中的结石梗阻和先天性梗阻也可引起射精疼痛。功能性包括性交频率过高，特别是白天性交后，会阴或阴囊疼痛。此外，性生活过于兴奋，强烈的动作也可引起射精痛。心理性的包括性格不佳，或者因为性生活中的一些失败，或者一些工作压力等，导致焦虑太大，导致射精太多，诱发会阴肌肉的收缩，多数是由紧张的心理因素引起的。此外，一些阴茎头特别敏感。当手接触龟头时，会有一种疼痛感。应该说它与心理因素有一定的关系。
综上所述，射精疼痛的原因有这些种类，首先要排除感染炎症肿瘤结石，其次才能考虑功能性或者心理性因素。
