性功能障碍可以发生于男性，也可以发生于女性。性功能障碍的发生主要是由于身体疾病或者心理因素导致的。因此治疗性功能障碍主要是治疗身体疾病的以及改善心理状况。
　　治疗身体原因主要是通过一些药物来治疗患者的缺陷，近年来，对于男性勃起障碍的治疗已经得到很好的效果，伟哥的出现帮助了勃起障碍的患者找回了自信。射精障碍的治疗主要是通过手术切断神经减少神经冲动的情况，这样就可以治疗男性的性功能障碍，这对于早泄患者有一定的疗效。
　　对于女性来说治疗性功能障碍的问题，润滑凝胶或乳膏或激素疗法可以解决阴道干燥的问题。这样就解决了女性的身体问题，以减少性生活中的疼痛不适等问题。
　　治疗心理的原因主要是心理咨询提供的帮助，患者得到心理治疗师的帮助改善了自身的压力的缓解问题，这类治疗一般是伴侣一同治疗会出现很大的效果，彻底解决了问题。有时，对性行为的支持和教育就是患者所需要的，他们可以在咨询中解决身体形象和其他抑制问题。对于根深蒂固的性功能障碍，可能需要进行心理治疗。
　　这类疾病一直是人们不能直接面对的，但是时间越长就会导致问题更加严重，大多数时候，性功能障碍患者的治疗前景非常好。但是克服不了观念。因此，当患病时，应当及时就诊。