3个月宝宝干呕频繁，主要原因包括外界刺激、饮食不节、发育异常、感染、咽部炎症等疾病，建议及时就诊，针对不同病因进行处理。

1、外界刺激：腹部受寒，导致胃部肌肉痉挛，引起干呕，建议适当热敷、轻揉腹部，可缓解症状。

2、饮食不节：进食过多、过快或进食不易消化食物，导致消化不良，吸入过多空气，胃排空时导致干呕。如存在消化不良，可在医生的指导下使用促进胃动力药物，如多潘立酮混悬液、枸橼酸莫沙必利口服溶液等。

3、发育异常：如果宝宝的食道下端括约肌功能缺陷或胃肠功能不完善，可能会出现消化不良的现象，能会伴有吸收和消化能力紊乱，容易伴有干呕的症状，此时需要进行手术处理。

4、感染：进食不洁食物，导致胃肠道感染，引起炎症反应，出现胀气，呼吸系统感染也会引起干呕症状，如上呼吸道感染、肺炎，如存在消化道细菌感染可遵照医嘱使用抗生素进行抗感染治疗，如注射用盐酸头孢替安、注射用头孢他啶。

5、咽部炎症：可出现咽部红肿、吞咽困难等情况，宝宝因此而有干呕现象，若存在咽炎，可以遵医嘱针对病因使用抗生素或抗病毒药物，如罗红霉素干混悬剂、感冒清热颗粒等。

除上述情况外，其他可能的情况有病毒性肝炎等，导致肝功能损伤，影响胆汁排泄、分泌，出现恶心、干呕等消化不良症状，如存在肝功能异常可遵医嘱服用护肝药物。