阴茎上长痘痘，引起的原因有很多，通常和毛囊炎、龟头包皮炎、阴茎疱疹、珍珠样丘疹、皮脂腺囊肿、皮脂腺瘤、尖锐湿疣、传染性软疣、梅毒等有关。
1、毛囊炎：主要见于免疫力低下，毛发牵拉、摩擦、搔抓引起的皮肤破溃使病原菌入侵毛囊。如果患者患有毛囊炎，可表现出阴茎长痘痘的症状，当发生在阴囊部位时，表现为红色丘疹，可伴有瘙痒，周围皮肤红肿，常有硬包。逐渐局部充血硬化，红肿、疼痛，结节中央顶端可出现黄白色小脓栓。可根据病情选择适当的抗生素，如头孢、红霉素、林可霉素等，注意个人卫生；
2、龟头包皮炎：是指阴茎头、包皮及冠状沟的炎性疾病，是龟头炎和包皮炎的统称。由于包皮过长，容易隐藏污垢，以及会阴部潮湿，清洁不到位等引起。表现为红肿热痛，局部破溃，脓性分泌物刺激，有可能出现阴茎上长痘痘的现象。应注意个人卫生，定期清洁私处，保持局部清洁、干燥，对于包皮过长者应尽早手术治疗；
3、阴茎疱疹：为感染单纯疱疹病毒引起的一种性传播疾病，表现为龟头、包皮、冠状沟和阴茎背侧皮肤出现水疱，破溃后会形成溃疡。通常使用抗病毒药物进行治疗，如阿昔洛韦、阿糖腺苷等，还需要避免不洁性生活，活动性生殖器疱疹者禁止性生活。保持病变部位清洁干燥，防止感染、破溃，忌食辛辣刺激食品，禁烟酒；
4、珍珠样丘疹：病因不明，可能是生理发育上的变异，呈现环绕阴茎冠状沟分布的成串小圆顶状丘疹。为白色、肤色或淡红色小丘疹，一般无自觉症状，无需治疗；
5、皮脂腺囊肿：是皮脂腺导管阻塞后内容物潴留所形成的的囊性肿块。可在局部麻醉下将囊壁完整切除，残留囊壁易复发。有感染时应用抗生素及局部理疗。感染严重应切开引流；
6、皮脂腺瘤：是由皮脂腺排泄障碍导致局部堵塞，结缔组织包裹脂肪形成皮脂腺瘤。多见于面部、头部，偶有发生在生殖器皮肤，表现为圆形、坚硬、肉色或蜡黄色结节，一经发现可口服抗菌药物，并行手术将其摘除；
7、尖锐湿疣：可通过性接触而感染，典型表现为初起为小的淡红色丘疹，后逐步增大加多，表面凹凸不平，潮湿柔软，呈乳头样、蕈样或菜花样崛起，伴瘙痒、表面糜烂、脓性分泌物、恶臭等，可进行激光、微波、红外线等仪器治疗，辅以免疫抑制剂和抗病毒药物，性伴侣应同治，避免交叉感染；
8、传染性软疣：是由痘病毒中的传染性软疣病毒所致的病毒性皮肤病，皮肤出现蜡样光泽的珍珠状小丘疹、顶端凹陷并能挤出乳酪样软疣小体。局部可给予物理治疗，如冷冻、激光，外用硝酸银、维A酸软膏进行涂抹，也可口服西咪替丁进行治疗。通常需要夫妻双方同治；
9、梅毒：Ⅰ期梅毒呈无痛性红色硬结，好发生于外生殖器，是由苍白密螺旋体引起的一种较为常见的慢性全身性性传播疾病，有的可以呈潜伏状态多年无症状。感染途径主要是通过性接触直接感染，即性交时皮肤黏膜擦伤，螺旋体从擦伤部位侵入。也可通过胎盘血液传播给胎儿，引起胎儿感染。治疗首选青霉素，对青霉素过敏者可选用四环素、阿奇霉素等药物治疗。