蝙蝠在屋里飞有可能会传染病毒，多数情况下蝙蝠需要通过中间宿主动物传播病毒给人类，但也可通过空气传播和直接接触传播病毒。我国蝙蝠种类众多，主要分布在海南、广东、广西、云南省，带病毒的蝙蝠品种包括普通蝙蝠、马铁菊头蝠、大蹄蝠以及棕果蝠等。蝙蝠携带的病毒也很多，包括乙型脑炎病毒、登革热病毒、SARS冠状病毒、狂犬病病毒等。

蝙蝠可通过空气传播来传播病毒，这些病毒来自蝙蝠的腺体分泌物或排泄物，主要以气溶胶的形式存在于空气中，如狂犬病病毒和冠状病毒可能会以这种方式传播。此外，被蝙蝠抓伤或咬伤后、食用蝙蝠或食用捕食过蝙蝠的动物都有可能会被感染病毒。蝙蝠的分泌物或蝙蝠吃过的食物也可能含有病毒，人们在接触这些东西后也有可能会感染上病毒。

如果发现蝙蝠进屋，要提高自我防护意识，不要滥捕蝙蝠，假如不慎被蝙蝠咬伤或抓伤，要及时前往医院进行检查并接种狂犬疫苗。