基因突变可由物理因素、化学因素、生物因素三种方式引起。通常情况下基因具有较强稳定性，不易产生变化，但是基因在一定程度的内外环境因素作用下，可以发生基因突变。

一、物理因素：

1、紫外线：紫外线照射可以引起遗传物质的损伤，使胸腺嘧啶发生异常改变，影响DNA链结构，当发生DNA复制时，可以出现碱基配对错误，从而引起基因突变。所以长时间暴晒容易引起基因突变；

2、电离辐射：如X射线、α射线、β射线、γ射线等，电离辐射可以击穿遗传物质，造成DNA的断裂损伤，容易引起基因突变。但需要一定剂量的射线才会引起基因突变。

二、化学因素：

如羟胺类、亚硝酸类化学物质可将正常碱基对替换为错误碱基，在复制过程中可能会产生错误，导致基因突变。碱基类似物质也可能掺杂在DNA分子中取代正常碱基，造成配对错误，引起基因突变。此外，芳香族化合物能造成碱基的丢失或错位，甲醛、氯乙烯等烷化剂可以诱变基因，导致基因错误等，有一定可能引起基因突变。

三、生物因素：

一些病毒如流感病毒、疱疹病毒、细菌等，在复制病毒遗传物质的同时，可以破坏人体DNA的正常复制，诱变人体发生基因突变。