牙疼多数是由于需氧菌或者厌氧菌感染引起的炎症所致，如智齿冠周炎、牙髓炎、根尖周炎、牙周炎等疾病，都会造成不同程度的牙疼。服用甲硝唑和牛黄甲硝唑均能治疗牙疼，相比之下，甲硝唑药物作用较强，可以缓解大多数厌氧菌感染引起的牙周炎，但具体要根据病因、药效等，合理选择用药。

甲硝唑与牛黄甲硝唑最大的区别是成分上的不同，牛黄甲硝唑属于复方药，成分中包括人工牛黄和甲硝唑两种。人工牛黄最主要的作用是解热止痛，与甲硝唑药物相比，含有的甲硝唑成分较少，因此牛黄甲硝唑的消炎作用，相对于甲硝唑较小。故如是根尖炎、牙周炎等炎症较重的疾病所引起的牙疼，需要及时进行消炎处理时，建议应用甲硝唑治疗；但如果患者炎症反应较小，只是轻度的疼痛，则可以用牛黄甲硝唑解热止痛。

但仍有部分牙疼无法通过上述两种药物缓解，需要针对具体情况进行相应处理。如牙髓炎，由于牙髓组织发炎导致牙体硬组织压迫出现疼痛，上述药物无法达到解除压迫的作用，因此出现牙髓炎时服用上述药物，并不奏效；三叉神经痛引起的牙疼也不可能通过上述药物缓解，这是因为两者并不会作用于三叉神经。另外，还有一些炎症是由需氧菌或者厌氧菌合并感染引起的，治疗时除服用甲硝唑、牛磺甲硝唑外，还应服用头孢、阿莫西林或者红霉素等联合治疗。

此外，牙疼除了服用药物来缓解症状外，还应该积极寻找病因，进行对因治疗，如牙髓炎、根尖周炎导致的牙疼还应及时进行根管治疗，以达到彻底控制感染，避免疼痛反复发作的目的。