对于支原体感染的患者，使用红霉素或阿奇霉素都可行，因为这两种药物均属于大环内酯类，其中还包括罗红霉素，都为支原体感染的首选用药。有部分患者对大环内酯类的药物不敏感时，可选用氟喹诺酮类的药物进行治疗，例如常用的有左氧氟沙星或莫西沙星等等。

除此以外，四环素类的药物也可以用于肺炎、支原体肺炎的治疗，但是四环素类的药物不良的反应比较多，使用需要慎重，通常疗程需要在2-3周才能治愈。还需要特别注意，肺炎支原体是一个无细胞壁的病原菌，因此青霉素、头孢菌素类的药物对其无效，在使用的时候需要注意，避免选用。