如果做了药物流产两个月之后还发现宫腔内有残留可以清宫，宫腔内如果一直有残留的组织会影响月经，对以后怀孕也会有影响。因为药流的时间已经比较久了，残留的组织粘在子宫壁上已经比较紧，在做手术的过程中难度会稍微大。建议在宫腔镜下进行清宫手术，手术成功的概率会高，损伤也会小。

长时间的残留对内膜也会有一定的影响，在做完清宫手术之后还要注意内膜的修复，需要使用促进内膜生长的药物。还要注意月经的情况，预防感染等等，以免造成妇科方面的炎症。