睡醒以后眼睛疼痛有可能是以下几种原因：

1、睑腺炎：睑腺炎是睑板腺感染，由金黄色葡萄球菌感染比较多见，引起睑板腺急性炎症，表现为眼睑局部的疼痛、红肿、皮肤温度升高。

2、暴露性角膜炎：睡醒以后眼睛疼痛，有可能是发生了暴露性角膜炎，表现为眼睛疼痛，特别是在上睑下垂矫正术后，睑裂闭合不全，或者是外伤引起了眼睑列缺损、闭合不全等情况，在睡眠以后，睑裂不能闭合遮盖角膜，这样形成暴露性角膜炎，表现睡醒以后眼睛疼痛。

3、青光眼：青光眼发作以后，往往也会表现为眼睛疼痛，建议及时到医院眼科进行就诊，以明确眼压的情况，如果诊断为青光眼，则需要及时的进行药物、激光或手术的治疗方法，进行积极治疗。