怀孕2个月胚胎停育是不可以进行药物流产的，药物流产适用于停经49天内的妊娠，而且是新鲜的胚胎组织，在服药后可以利于宫腔的妊娠组织及时的排出，但是胚胎停育后的妊娠囊可能与宫腔粘连比较致密，在服药后可能会存在药物流产失败，或者宫腔残留的可能。如果胚胎停止发育的时间比较长，可能还会对凝血功能造成一定的影响，在服药后可能会出现阴道出血量多，出血时间长，造成失血性贫血。

对于怀孕2个月的胚胎停孕，最好的方法还是采取超导监测下的人工流产手术，可以一次性的将宫腔的妊娠组织清除，对女性的身体伤害比较小一些。