目前骨髓移植是治疗某些血液系统疾病的一种比较重要的方法，但是不同的疾病做骨髓移植治疗之后，生存率也是不同的。对于急性髓系白血病的患者，做骨髓移植之后，5年生存率可以达到50%-60%。
对于急性淋巴细胞白血病，骨髓移植后5年生存率可以达到50%左右。对于再生障碍性贫血的患者，如果患者的年龄小于40岁，是重型再障或者极重型再障，而且有合适的HLA相合的同胞供者，如果做骨髓移植，移植之后80%以上的患者可以长期生存，
有报道称，再障患者骨髓移植之后8年的无病生存率可以达到90%。虽然有的患者骨髓移植之后可以生存很长时间，但是有一部分患者移植之后会复发，多发生在移植后的3年之内，复发之后治疗就比较困难，预后也比较差。
