巧克力囊肿即卵巢巧克力囊肿，子宫内膜异位症不是卵巢巧克力囊肿，卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种病变形式，建议患者在医院妇科就诊，明确具体疾病，然后在医生指导下积极进行治疗。

子宫内膜组织，如腺体和间质出现在子宫体以外的部位时，称为子宫内膜异位症，大多数会异位于盆腔脏器和壁腹膜，以卵巢、宫骶韧带最常见，其次为子宫及其他脏腹膜、阴道直肠隔等部位，患者的主要症状为下腹痛、痛经、不孕及性生活不适。

当卵巢异位的子宫内膜侵犯时，便可导致卵巢巧克力囊肿，约80%病变累及一侧，累及双侧的占50%。通常卵巢巧克力囊肿表面呈灰蓝色，大小不一，直径多在5cm左右，大到10-20cm。典型情况下，陈旧性血液聚积在其内部可形成咖啡色黏稠液体，似巧克力样，因此称为卵巢巧克力囊肿。

对于子宫内膜异位症与卵巢巧克力囊肿来讲，二者属于包含关系，患者应避免自行诊断。应到医院妇科就诊，进行B超检查等明确，然后积极进行治疗。