输尿管结石的主要临床病理损伤是会导致结石以上的尿路积水，也就是会导致结石以上的输尿管以及肾盂积水，会导致肾盂内的压力逐渐升高，进而使肾功能受损。所以输尿管结石的主要危害，是会导致单侧肾功能损伤。

如果在使用药物治疗时结石无法排出，患者需要考虑通过体外冲击波碎石或者做内镜手术来治疗。输尿管上段结石，如果结石直径在0.6-1cm，患者可以选择体外冲击波碎石。体外冲击波碎石失败或者结石直径大于1cm，患者可以选择做输尿管镜或者输尿管软镜的碎石方式。输尿管下段结石的患者，首选输尿管镜碎石。