用棉签掏耳朵通常不好，如果感觉耳朵瘙痒，或者分泌物较多，建议及时到医院就诊，请医生帮忙清理耳朵。
如果用棉签掏耳朵，会把耳垢推到耳朵深部，可能造成听力下降，甚至损坏鼓膜。除了棉签，最好不要用其他东西掏耳朵，耳朵不需要经常掏，因为耳屎对耳朵有保护作用，如果掏得太干净，反而让耳朵变得更加敏感。而且耳朵本身有自我清洁功能，在吃饭或者说话时，耳朵也会被带着运动，这样可以自动将耳屎排出。
此外，不是油性或者结成块的耵聍都不需要进行特别清理，除非是质地较硬或者油性耵聍把外耳道堵塞，此时也不建议自行清理，需要请医生使用耵聍钩、镊子等帮助取出。注意在洗头、洗澡后耳朵可能会进水，这时可以用棉签把进入耳道的水液轻轻擦拭干净。
经常掏耳朵使得耳朵变得敏感之后，会容易受到病原体感染，可能会出现耳痛、耳胀、耳道流脓等症状。如果出现不适症状，建议及时到医院耳鼻喉科就诊，进行血常规、耳镜等检查明确诊断，之后可能需要在医生的指导下使用盐酸洛美沙星滴耳液、氧氟沙星滴耳液等药物进行治疗。