新生儿的抵抗力比较弱，血脑屏障发育不完善。新生儿在发生上呼吸道感染、皮肤感染、肠炎、脐炎、肺炎或者存在宫内感染的情况下，都可以引起脑炎。

新生儿有严重感染症状，高热不退或者高度怀疑脑炎的时候，一定要及时完善腰穿检查。新生儿脑炎主要分为细菌性脑炎和病毒性脑炎，在新生儿当中发病率比较高的是细菌性脑膜炎，常见的病原菌有大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌。细菌性脑膜炎是发生于脑膜的炎症，病毒性脑炎是发生于脑实质的炎症。