生殖器疱疹对于男性和女性在症状表现上并没有特殊的不同。只不过发生的部位，会由于患者生理发育上的差异有一定的差异。男性多发生在龟头、包皮、冠状沟上，而女性多在阴唇、阴蒂以及阴阜部位出现。而生殖器疱疹的典型特征表现就是在这些部位会出现簇集状存在的水疱，患者往往会伴有局部的疼痛感。

水疱一般在出现以后一周之内，可以自行破溃，破溃后患者会在局部发现有溃疡，这些溃疡可以慢慢地自行痊愈。在生殖器疱疹的病程过程当中，患者还伴有全身症状，像发烧、头疼、乏力、不欲吃饭，而且还会伴有局部淋巴结肿大。